23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2419 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  308  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  295  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2738  hypothetical protein  51.35 
 
 		 211 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0555489  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  43.3 
 
 		 202 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  43.3 
 
 		 198 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  33.86 
 
 		 457 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1195  hypothetical protein  41.98 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1386  hypothetical protein  69.44 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  29.41 
 
 		 354 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3235  hypothetical protein  36 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  35.96 
 
 		 450 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  37.8 
 
 		 441 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  35.16 
 
 		 443 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  30.3 
 
 		 509 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2350  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.53 
 
 		 317 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  30.83 
 
 		 558 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  31.4 
 
 		 463 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  35.71 
 
 		 562 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  35.71 
 
 		 475 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2247  hypothetical protein  27.78 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  31.11 
 
 		 562 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  32.58 
 
 		 431 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  33.72 
 
 		 482 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>