19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2794 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  294  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2738  hypothetical protein  52.88 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0555489  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  44.44 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  43.33 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  35.4 
 
 		 457 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1195  hypothetical protein  46.38 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  41.43 
 
 		 441 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3235  hypothetical protein  37.5 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  38.67 
 
 		 450 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  37.66 
 
 		 443 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  29.2 
 
 		 354 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  31.09 
 
 		 509 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2350  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.76 
 
 		 317 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  32.38 
 
 		 558 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  32.88 
 
 		 463 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1386  hypothetical protein  65.52 
 
 		 74 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  35.9 
 
 		 562 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  37.88 
 
 		 475 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>