19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2439 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
450 aa  888    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  49.86 
 
 
443 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  48.38 
 
 
457 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  40.52 
 
 
354 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  34.33 
 
 
431 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  38.48 
 
 
475 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  36.5 
 
 
441 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  36.75 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  32.2 
 
 
509 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  36.86 
 
 
469 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  37.82 
 
 
558 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  35.4 
 
 
562 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  35.21 
 
 
562 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  34.43 
 
 
463 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  35.96 
 
 
147 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  38.67 
 
 
140 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  36.47 
 
 
198 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  36.26 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2738  hypothetical protein  35.42 
 
 
211 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0555489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>