16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0832 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  845    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  52.89 
 
 
354 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  42.5 
 
 
509 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  43.33 
 
 
475 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  38.64 
 
 
482 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  37.53 
 
 
441 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  37.84 
 
 
469 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  37.36 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  40.37 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  36.34 
 
 
450 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  42.18 
 
 
558 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  42.31 
 
 
562 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  37.07 
 
 
562 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  52.85 
 
 
463 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0839  hypothetical protein  98.21 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0637291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  34.07 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>