17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0777 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  715    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  52.89 
 
 
431 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  46.45 
 
 
475 aa  315  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  44.19 
 
 
509 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  44.67 
 
 
441 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  44.51 
 
 
482 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  43.24 
 
 
469 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  43.75 
 
 
562 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  41.72 
 
 
450 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  44.01 
 
 
558 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  42.99 
 
 
562 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  34.52 
 
 
443 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  37.39 
 
 
457 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  35.21 
 
 
463 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0839  hypothetical protein  48.15 
 
 
94 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0637291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>