18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0743 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
509 aa  1033    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  46.1 
 
 
441 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  42.56 
 
 
475 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  42.86 
 
 
469 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  41.47 
 
 
482 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  44.19 
 
 
354 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  43.52 
 
 
431 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  43.48 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  43.36 
 
 
562 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  44.29 
 
 
562 aa  226  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  35.36 
 
 
463 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  32.26 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  32.77 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  34.51 
 
 
457 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1283  agglutinin receptor  24.3 
 
 
1631 aa  51.6  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  30.3 
 
 
147 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  31.09 
 
 
140 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  29.25 
 
 
202 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>