17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0081 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  926    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  53.92 
 
 
562 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  52.71 
 
 
558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  48.5 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  35.26 
 
 
509 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  49 
 
 
475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  41.64 
 
 
482 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  42.02 
 
 
441 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  52.83 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  35.21 
 
 
354 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  37.45 
 
 
443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  39.7 
 
 
431 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  44.87 
 
 
450 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  37.04 
 
 
457 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  31.4 
 
 
147 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  31 
 
 
202 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  32.88 
 
 
140 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>