23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6245 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  100 
 
 
443 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  60.05 
 
 
457 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  47.04 
 
 
450 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  37.17 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  33.63 
 
 
354 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  36.45 
 
 
475 aa  203  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  35.6 
 
 
441 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  36.12 
 
 
482 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  32.26 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  36.06 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  35.29 
 
 
562 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  38.43 
 
 
558 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  38.02 
 
 
463 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  34.14 
 
 
562 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4223  hypothetical protein  57.14 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151721  normal  0.210666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1798  hypothetical protein  64.1 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119573  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15910  hypothetical protein  60.53 
 
 
568 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  35.16 
 
 
147 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0102  Excalibur domain protein  48.78 
 
 
318 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  37.66 
 
 
140 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23280  hypothetical protein  58.82 
 
 
382 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595186  normal  0.0736957 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  36.47 
 
 
198 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0794  Pyrrolo-quinoline quinone  60.53 
 
 
818 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.475878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>