17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0187 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2738  hypothetical protein  42.65 
 
 
211 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0555489  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  37.63 
 
 
202 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  43.3 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  43.33 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3235  hypothetical protein  33.57 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0789  hypothetical protein  30.94 
 
 
468 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1195  hypothetical protein  31.61 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  37.61 
 
 
457 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2350  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.02 
 
 
317 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  36.47 
 
 
450 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  36.47 
 
 
443 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  32.73 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  33.63 
 
 
509 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2247  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  35.8 
 
 
475 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  31.13 
 
 
354 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>