13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3235 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3235  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2247  hypothetical protein  49.49 
 
 
272 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158777  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2350  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.92 
 
 
317 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00381  hypothetical protein  46.05 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  33.57 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2738  hypothetical protein  43.24 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0555489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  36 
 
 
147 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  31.33 
 
 
457 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1195  hypothetical protein  33.72 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  28.12 
 
 
450 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  34.12 
 
 
509 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  34.15 
 
 
441 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>