17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01989 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01989  Chromosome segregation ATPase  100 
 
 
441 aa  896    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0743  chromosome segregation ATPase  46.1 
 
 
509 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3068  chromosome segregation ATPase  48.1 
 
 
475 aa  359  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.0733168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1291  chromosome segregation ATPase  45.39 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1847  chromosome segregation ATPase  43.84 
 
 
482 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0777  hypothetical protein  43.77 
 
 
354 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0832  hypothetical protein  41.98 
 
 
431 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1522  hypothetical protein  42.73 
 
 
562 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1341  hypothetical protein  43.11 
 
 
558 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3188  hypothetical protein  37.13 
 
 
562 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6245  putative ATPase  38.12 
 
 
443 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162013  normal  0.387295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5581  Putative helicase A859L  38.78 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2439  chromosome segregation ATPase  35.73 
 
 
450 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0081  hypothetical protein  56.95 
 
 
463 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2419  hypothetical protein  37.8 
 
 
147 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.0517279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2794  hypothetical protein  41.43 
 
 
140 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0187  hypothetical protein  32.73 
 
 
198 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00966073  normal  0.852602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>