190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0250 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0250  DhaKLM operon coactivator DhaQ  100 
 
 
328 aa  674    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1647  DhaKLM operon coactivator DhaQ  55.03 
 
 
328 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0087743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1047  DhaKLM operon coactivator DhaQ  46.39 
 
 
332 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7822e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1052  DhaKLM operon coactivator DhaQ  46.69 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00716386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.59 
 
 
329 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0905  DhaKLM operon coactivator DhaQ  46.39 
 
 
332 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0963  DhaKLM operon coactivator DhaQ  46.39 
 
 
332 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1006  DhaKLM operon coactivator DhaQ  46.08 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.795542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0868  DhaKLM operon coactivator DhaQ  45.78 
 
 
332 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0887  DhaKLM operon coactivator DhaQ  45.78 
 
 
332 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.211462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1132  DhaKLM operon coactivator DhaQ  45.78 
 
 
332 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0873  DhaKLM operon coactivator DhaQ  46.69 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4296  DhaKLM operon coactivator DhaQ  45.48 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  40.76 
 
 
582 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.06 
 
 
332 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.44 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.25 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  39.26 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.43 
 
 
329 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  39.87 
 
 
583 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  39.87 
 
 
583 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  39.87 
 
 
583 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.24 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  40.2 
 
 
583 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  38.92 
 
 
583 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  39.87 
 
 
583 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  39.87 
 
 
583 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  39.56 
 
 
583 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  40.2 
 
 
583 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  39.87 
 
 
583 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  40.2 
 
 
583 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.79 
 
 
332 aa  206  5e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.3 
 
 
331 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.45 
 
 
333 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.64 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.58 
 
 
332 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.46 
 
 
322 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.46 
 
 
322 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.89 
 
 
333 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  37.05 
 
 
567 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  37.95 
 
 
567 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.86 
 
 
332 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.69 
 
 
320 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  33.52 
 
 
352 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  35.05 
 
 
616 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.18 
 
 
333 aa  192  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.34 
 
 
333 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.25 
 
 
329 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  34.74 
 
 
566 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  35.05 
 
 
569 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  35.05 
 
 
569 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.3 
 
 
332 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  34.95 
 
 
334 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.35 
 
 
330 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  37.35 
 
 
616 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  37.35 
 
 
570 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  37.35 
 
 
570 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.61 
 
 
333 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.52 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.05 
 
 
329 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.05 
 
 
329 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.8 
 
 
369 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  37.05 
 
 
570 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.87 
 
 
329 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.8 
 
 
356 aa  188  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  33.8 
 
 
356 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  33.8 
 
 
356 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  33.8 
 
 
356 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.52 
 
 
356 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.8 
 
 
356 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  37.65 
 
 
567 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  34.44 
 
 
572 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  33.43 
 
 
580 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.52 
 
 
356 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.42 
 
 
330 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.62 
 
 
333 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  35.56 
 
 
334 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  34.39 
 
 
577 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.35 
 
 
333 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.31 
 
 
332 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.24 
 
 
331 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.14 
 
 
333 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  34.44 
 
 
566 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.13 
 
 
330 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.53 
 
 
364 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  33.13 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.11 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  34.29 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.05 
 
 
333 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  33.76 
 
 
333 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  31.85 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  35.2 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.43 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  33.02 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  33.66 
 
 
333 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  34.44 
 
 
327 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  35.76 
 
 
333 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  36.49 
 
 
598 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  34.45 
 
 
333 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  33.73 
 
 
544 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>