105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0111 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0111  CutC family protein  100 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4782  CutC family protein  52.43 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.853064  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4340  CutC family protein  51.46 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6298  hypothetical protein  45.31 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.981767  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_002950  PG0714  copper homeostasis protein CutC  41.71 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0376007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5700  CutC family protein  39.37 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0379  CutC family protein  33.17 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01038  hypothetical protein  40.47 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2243  CutC family protein  40.64 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000244128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2068  CutC family protein  41.29 
 
 		 241 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0035151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2183  CutC family protein  34.12 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2442  copper homeostasis protein CutC  34.87 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2121  copper homeostasis protein CutC  42.86 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000595386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2610  copper homeostasis protein CutC  41.05 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34940  uncharacterized protein involved in copper resistance  51.69 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2061  copper homeostasis protein CutC  42.38 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1216  copper homeostasis protein CutC  42.86 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1340  copper homeostasis protein CutC  42.86 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249959  hitchhiker  0.00015365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1969  copper homeostasis protein CutC  41.05 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1758  copper homeostasis protein CutC  41.05 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.147041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01834  hypothetical protein  41.05 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004375  cytoplasmic copper homeostasis protein CutC  39.25 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1766  CutC family protein  41.05 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.570596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2106  copper homeostasis protein CutC  41.05 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1312  copper homeostasis protein CutC  40.17 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.282361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0615  CutC family protein  42.59 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0059352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6564  CutC family protein  39.34 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.397235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0696  copper homeostasis protein  42.13 
 
 		 268 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2440  copper homeostasis protein CutC  41.43 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3411  CutC family protein  41.43 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2167  copper homeostasis protein CutC  40.61 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2143  CutC family protein  31.22 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.100517  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6254  copper homeostasis protein  41.98 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0546193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1768  CutC family protein  44.55 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0153  CutC family protein  40 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3976  CutC family protein  42.38 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.298928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0253  CutC family protein  33.49 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0147  CutC family protein  39.47 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2086  copper homeostasis protein CutC  38.21 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2066  copper homeostasis protein CutC  42.38 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0263  copper homeostasis protein  38.68 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3488  CutC family protein  38.28 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1809  copper homeostasis protein CutC  35.87 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0254  CutC family protein  35.15 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2040  copper homeostasis protein CutC  38.97 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2431  copper homeostasis protein CutC  38.97 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0488343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2153  copper homeostasis protein CutC  38.97 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2171  copper homeostasis protein CutC  38.21 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.728264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4050  CutC family protein  44.34 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01619  copper homeostasis protein  44.23 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0248  copper homeostasis protein CutC, putative  34.65 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2268  copper homeostasis protein CutC  37.56 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0416  CutC family protein  41.95 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.378773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1517  copper homeostasis protein  41.45 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0127  CutC  39.39 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4291  putative copper homeostasis protein CutC  40.98 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2788  copper homeostasis protein CutC  37.85 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2065  CutC family protein  33.18 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0160506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1569  copper homeostasis protein CutC, putative  32.37 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3124  copper homeostasis protein CutC, putative  31.5 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00332926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3091  putative copper homeostasis protein CutC  32.5 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.448462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2852  copper homeostasis protein  31.5 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2813  copper homeostasis protein  31.5 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0344066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3105  putative copper homeostasis protein CutC  31.5 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2276  hypothetical protein  33.66 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3123  putative copper homeostasis protein CutC  31.5 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2145  putative copper homeostasis protein CutC  32 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2425  CutC  35.63 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.424028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1634  CutC family protein  29.9 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000333988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2885  copper homeostasis protein CutC  31 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3100  copper homeostasis protein CutC  31 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0130724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08940  uncharacterized protein involved in copper resistance  40.69 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2879  CutC family protein  31.5 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1429  copper resistance protein  30.29 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000338981  normal  0.032056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1702  CutC family protein  38.03 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223497  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0470  CutC family protein  27.59 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0104  cutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0569  CutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3076  cutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2018  cutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0387  CutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0408  cutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2268  cutC family protein  40.98 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0301  CutC  36.53 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0331  CutC family protein  39.38 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0141  CutC family protein  41.18 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0477  copper homeostasis protein CutC, putative  31.03 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0336  cutC family protein  41.53 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6287  CutC family protein  39.89 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1447  copper resistance protein  33.16 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000498343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2984  CutC family protein  39.22 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00017  copper homeostasis protein CutC, putative (JCVI)  32.99 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2321  CutC  39.89 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2935  CutC family protein  39.89 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2957  CutC family protein  40.44 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0360  CutC family protein  40.44 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2847  CutC family protein  39.34 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.443525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01845  copper homeostasis protein  37.17 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2098  CutC family protein  33.97 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0830016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0537  CutC family protein  32.38 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>