105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2167 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2167  copper homeostasis protein CutC  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1969  copper homeostasis protein CutC  98.79 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1758  copper homeostasis protein CutC  98.79 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.147041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01834  hypothetical protein  98.79 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2610  copper homeostasis protein CutC  98.39 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1766  CutC family protein  97.58 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.570596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2106  copper homeostasis protein CutC  97.58 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1312  copper homeostasis protein CutC  97.58 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.282361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2121  copper homeostasis protein CutC  83.06 
 
 		 248 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000595386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2061  copper homeostasis protein CutC  83.47 
 
 		 248 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1216  copper homeostasis protein CutC  83.06 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1340  copper homeostasis protein CutC  83.06 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249959  hitchhiker  0.00015365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2066  copper homeostasis protein CutC  83.06 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2440  copper homeostasis protein CutC  72.76 
 
 		 247 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1809  copper homeostasis protein CutC  59 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2086  copper homeostasis protein CutC  58.58 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2171  copper homeostasis protein CutC  59.41 
 
 		 254 aa  301  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.728264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2153  copper homeostasis protein CutC  56.56 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2268  copper homeostasis protein CutC  59 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01845  copper homeostasis protein  99.32 
 
 		 146 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2040  copper homeostasis protein CutC  56.56 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2431  copper homeostasis protein CutC  55.74 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0488343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2788  copper homeostasis protein CutC  55.23 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5700  CutC family protein  47.32 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2143  CutC family protein  38.24 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.100517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6564  CutC family protein  40.25 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.397235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6298  hypothetical protein  46.41 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.981767  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2442  copper homeostasis protein CutC  36.86 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0714  copper homeostasis protein CutC  42.48 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0376007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2183  CutC family protein  38.94 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2068  CutC family protein  36.51 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0035151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3976  CutC family protein  41.47 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.298928 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0615  CutC family protein  46.97 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0059352  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0696  copper homeostasis protein  45.96 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0253  CutC family protein  41.58 
 
 		 223 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0263  copper homeostasis protein  39.05 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01038  hypothetical protein  38.08 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0111  CutC family protein  43.28 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3488  CutC family protein  39.9 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004375  cytoplasmic copper homeostasis protein CutC  39.05 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0379  CutC family protein  33.17 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2243  CutC family protein  34.71 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4782  CutC family protein  37.13 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.853064  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6254  copper homeostasis protein  38.58 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0546193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01619  copper homeostasis protein  43.23 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1768  CutC family protein  39.18 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0470  CutC family protein  34.52 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1517  copper homeostasis protein  36.92 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3091  putative copper homeostasis protein CutC  32.99 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.448462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0254  CutC family protein  35.03 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0248  copper homeostasis protein CutC, putative  36.36 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0147  CutC family protein  39.39 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2145  putative copper homeostasis protein CutC  32.04 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0153  CutC family protein  39.39 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3124  copper homeostasis protein CutC, putative  31.98 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00332926  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4291  putative copper homeostasis protein CutC  36.24 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0416  CutC family protein  36.87 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.378773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4340  CutC family protein  37.39 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3411  CutC family protein  34.14 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2852  copper homeostasis protein  30.96 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3105  putative copper homeostasis protein CutC  30.96 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2813  copper homeostasis protein  30.96 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0344066  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3123  putative copper homeostasis protein CutC  30.96 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2879  CutC family protein  30.46 
 
 		 225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2885  copper homeostasis protein CutC  30.46 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3100  copper homeostasis protein CutC  30.46 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0130724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1634  CutC family protein  31.75 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000333988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2065  CutC family protein  30.39 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0160506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4050  CutC family protein  39.02 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0141  CutC family protein  38.61 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34940  uncharacterized protein involved in copper resistance  35.44 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1569  copper homeostasis protein CutC, putative  32.85 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0127  CutC  39.1 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0301  CutC  32.75 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0104  cutC family protein  36.59 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0569  CutC family protein  37.07 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3076  cutC family protein  36.59 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2018  cutC family protein  36.59 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0387  CutC family protein  37.07 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0408  cutC family protein  37.07 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2268  cutC family protein  36.59 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2276  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0477  copper homeostasis protein CutC, putative  32.62 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2984  CutC family protein  35.59 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2425  CutC  35.44 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.424028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6287  CutC family protein  35.59 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1702  CutC family protein  33.19 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223497  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00017  copper homeostasis protein CutC, putative (JCVI)  30.4 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0331  CutC family protein  32.31 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0336  cutC family protein  36.1 
 
 		 294 aa  88.6  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2098  CutC family protein  30.85 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0830016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2321  CutC  35.59 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2935  CutC family protein  35.59 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2847  CutC family protein  35.59 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2957  CutC family protein  35.59 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1429  copper resistance protein  27.54 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000338981  normal  0.032056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0360  CutC family protein  34.65 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0103  CutC family protein  28.06 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08940  uncharacterized protein involved in copper resistance  29.96 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0537  CutC family protein  30.35 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>