104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2040 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2040  copper homeostasis protein CutC  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2153  copper homeostasis protein CutC  99.21 
 
 
254 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2431  copper homeostasis protein CutC  98.82 
 
 
254 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0488343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2788  copper homeostasis protein CutC  72.22 
 
 
252 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1809  copper homeostasis protein CutC  68.46 
 
 
252 aa  352  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2086  copper homeostasis protein CutC  68.05 
 
 
252 aa  347  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2171  copper homeostasis protein CutC  65.98 
 
 
254 aa  337  8e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.728264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2268  copper homeostasis protein CutC  65.57 
 
 
254 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2440  copper homeostasis protein CutC  58.61 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1766  CutC family protein  56.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.570596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1969  copper homeostasis protein CutC  56.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2106  copper homeostasis protein CutC  56.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1758  copper homeostasis protein CutC  56.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.147041  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2167  copper homeostasis protein CutC  56.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2121  copper homeostasis protein CutC  57.14 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000595386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2061  copper homeostasis protein CutC  56.73 
 
 
248 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01834  hypothetical protein  56.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1216  copper homeostasis protein CutC  56.73 
 
 
248 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1340  copper homeostasis protein CutC  56.73 
 
 
248 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249959  hitchhiker  0.00015365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1312  copper homeostasis protein CutC  55.74 
 
 
248 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.282361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2610  copper homeostasis protein CutC  56.15 
 
 
248 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2066  copper homeostasis protein CutC  56.73 
 
 
248 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5700  CutC family protein  43.78 
 
 
263 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2143  CutC family protein  40.57 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.100517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6564  CutC family protein  42 
 
 
253 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.397235  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0714  copper homeostasis protein CutC  41.74 
 
 
248 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0376007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2442  copper homeostasis protein CutC  39.67 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2183  CutC family protein  37.19 
 
 
248 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6298  hypothetical protein  43.13 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.981767  normal  0.120697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01845  copper homeostasis protein  54.23 
 
 
146 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004375  cytoplasmic copper homeostasis protein CutC  42.86 
 
 
249 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0263  copper homeostasis protein  41.05 
 
 
254 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01038  hypothetical protein  39.68 
 
 
247 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3976  CutC family protein  40.34 
 
 
243 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.298928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2068  CutC family protein  38.68 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0035151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0253  CutC family protein  38.42 
 
 
223 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0615  CutC family protein  38.62 
 
 
246 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0059352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0254  CutC family protein  40.7 
 
 
207 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3488  CutC family protein  42.21 
 
 
240 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0696  copper homeostasis protein  41.35 
 
 
268 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0248  copper homeostasis protein CutC, putative  40.7 
 
 
207 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1768  CutC family protein  44.04 
 
 
243 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6254  copper homeostasis protein  38.5 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0546193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0470  CutC family protein  35.78 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2879  CutC family protein  37.37 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4782  CutC family protein  40.38 
 
 
232 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.853064  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0379  CutC family protein  35.68 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3124  copper homeostasis protein CutC, putative  35.53 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00332926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2813  copper homeostasis protein  35.53 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0344066  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3123  putative copper homeostasis protein CutC  35.53 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3091  putative copper homeostasis protein CutC  36.04 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.448462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2852  copper homeostasis protein  35.53 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1517  copper homeostasis protein  38.78 
 
 
198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3105  putative copper homeostasis protein CutC  35.53 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2145  putative copper homeostasis protein CutC  35.53 
 
 
225 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2243  CutC family protein  38.57 
 
 
246 aa  129  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3411  CutC family protein  38.14 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2065  CutC family protein  36.04 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0160506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2885  copper homeostasis protein CutC  35.03 
 
 
225 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3100  copper homeostasis protein CutC  35.03 
 
 
225 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0130724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0111  CutC family protein  39.22 
 
 
254 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0153  CutC family protein  40.29 
 
 
241 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0147  CutC family protein  39.13 
 
 
241 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0416  CutC family protein  34.78 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.378773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01619  copper homeostasis protein  40.41 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4291  putative copper homeostasis protein CutC  36.17 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4340  CutC family protein  37.66 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0301  CutC  37.17 
 
 
265 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1634  CutC family protein  33.17 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000333988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34940  uncharacterized protein involved in copper resistance  35.96 
 
 
246 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350651  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4050  CutC family protein  38.86 
 
 
254 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0127  CutC  36.98 
 
 
245 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0141  CutC family protein  34.33 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618466  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0477  copper homeostasis protein CutC, putative  31.72 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2984  CutC family protein  33.83 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2425  CutC  35.92 
 
 
253 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.424028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0331  CutC family protein  33.5 
 
 
225 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0104  cutC family protein  33.83 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0569  CutC family protein  34.33 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2276  hypothetical protein  33.13 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3076  cutC family protein  33.83 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2018  cutC family protein  33.83 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0387  CutC family protein  34.33 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0408  cutC family protein  34.33 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2268  cutC family protein  33.83 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1569  copper homeostasis protein CutC, putative  30.39 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2098  CutC family protein  31.63 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0830016  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6287  CutC family protein  35.32 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00017  copper homeostasis protein CutC, putative (JCVI)  32.84 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1429  copper resistance protein  30.1 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000338981  normal  0.032056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1702  CutC family protein  33.33 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2321  CutC  35.32 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2935  CutC family protein  35.32 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2957  CutC family protein  35.32 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0336  cutC family protein  34.33 
 
 
294 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0103  CutC family protein  28.24 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2847  CutC family protein  34.33 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08940  uncharacterized protein involved in copper resistance  31.76 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0360  CutC family protein  32.84 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0537  CutC family protein  29.35 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>