81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01845 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01845  copper homeostasis protein  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01834  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  300  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1758  copper homeostasis protein CutC  100 
 
 		 248 aa  300  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.147041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1969  copper homeostasis protein CutC  100 
 
 		 248 aa  300  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2167  copper homeostasis protein CutC  99.32 
 
 		 248 aa  298  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2610  copper homeostasis protein CutC  99.32 
 
 		 248 aa  297  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1312  copper homeostasis protein CutC  97.95 
 
 		 248 aa  295  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.282361 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1766  CutC family protein  97.95 
 
 		 248 aa  295  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.570596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2106  copper homeostasis protein CutC  97.95 
 
 		 248 aa  295  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2066  copper homeostasis protein CutC  82.19 
 
 		 248 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2061  copper homeostasis protein CutC  81.51 
 
 		 248 aa  239  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2121  copper homeostasis protein CutC  81.51 
 
 		 248 aa  239  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000595386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1340  copper homeostasis protein CutC  81.51 
 
 		 248 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249959  hitchhiker  0.00015365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1216  copper homeostasis protein CutC  81.51 
 
 		 248 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2440  copper homeostasis protein CutC  66.43 
 
 		 247 aa  196  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1809  copper homeostasis protein CutC  55.47 
 
 		 252 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2040  copper homeostasis protein CutC  54.23 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2153  copper homeostasis protein CutC  54.23 
 
 		 254 aa  160  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2431  copper homeostasis protein CutC  53.52 
 
 		 254 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0488343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2086  copper homeostasis protein CutC  56.3 
 
 		 252 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2171  copper homeostasis protein CutC  56.3 
 
 		 254 aa  157  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.728264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2268  copper homeostasis protein CutC  54.74 
 
 		 254 aa  153  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2788  copper homeostasis protein CutC  51.82 
 
 		 252 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6564  CutC family protein  36.43 
 
 		 253 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.397235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6298  hypothetical protein  41.04 
 
 		 248 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.981767  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5700  CutC family protein  46.43 
 
 		 263 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1517  copper homeostasis protein  38.41 
 
 		 198 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2183  CutC family protein  38.89 
 
 		 248 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3976  CutC family protein  34.4 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.298928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2143  CutC family protein  32.12 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.100517  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0714  copper homeostasis protein CutC  39.34 
 
 		 248 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0376007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2442  copper homeostasis protein CutC  34.31 
 
 		 247 aa  77  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0615  CutC family protein  45.45 
 
 		 246 aa  73.9  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0059352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0263  copper homeostasis protein  42.71 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0696  copper homeostasis protein  44.44 
 
 		 268 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2068  CutC family protein  29.5 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0035151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01038  hypothetical protein  36.8 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4050  CutC family protein  43.16 
 
 		 254 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0248  copper homeostasis protein CutC, putative  36.9 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1768  CutC family protein  36.84 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0111  CutC family protein  39.78 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01619  copper homeostasis protein  39.39 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004375  cytoplasmic copper homeostasis protein CutC  40.62 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0254  CutC family protein  36.9 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0470  CutC family protein  40.51 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34940  uncharacterized protein involved in copper resistance  36 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0379  CutC family protein  30.91 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0153  CutC family protein  38.38 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2243  CutC family protein  29.08 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000244128  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6254  copper homeostasis protein  34.74 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0546193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0147  CutC family protein  38.38 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3488  CutC family protein  37.5 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4782  CutC family protein  33.33 
 
 		 232 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.853064  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0253  CutC family protein  40 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0301  CutC  30.83 
 
 		 265 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2145  putative copper homeostasis protein CutC  29.13 
 
 		 225 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3091  putative copper homeostasis protein CutC  29.47 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.448462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0141  CutC family protein  36.08 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0477  copper homeostasis protein CutC, putative  36.14 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3124  copper homeostasis protein CutC, putative  28.42 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00332926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3411  CutC family protein  30.14 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0127  CutC  58.82 
 
 		 245 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2098  CutC family protein  35.42 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0830016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2425  CutC  36.9 
 
 		 253 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.424028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6287  CutC family protein  31.58 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1702  CutC family protein  34.86 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3123  putative copper homeostasis protein CutC  26.32 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3105  putative copper homeostasis protein CutC  26.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2813  copper homeostasis protein  26.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0344066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3100  copper homeostasis protein CutC  26.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0130724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2852  copper homeostasis protein  26.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2885  copper homeostasis protein CutC  26.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2984  CutC family protein  31.4 
 
 		 241 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4291  putative copper homeostasis protein CutC  29.82 
 
 		 232 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1569  copper homeostasis protein CutC, putative  28.28 
 
 		 211 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2935  CutC family protein  31.15 
 
 		 241 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2321  CutC  31.15 
 
 		 241 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2879  CutC family protein  24.21 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0416  CutC family protein  31.58 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.378773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2847  CutC family protein  30.58 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2957  CutC family protein  31.15 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>