81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1917 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1917  multiple resistance and pH regulation protein F  100 
 
 		 85 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.851543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26970  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  57.65 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11090  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  54.12 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1733  multiple resistance and pH regulation protein F  44.71 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  33.73 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.15 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  39.29 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  37.84 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2932  multiple resistance and pH regulation protein F  50 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0996  pH adaption potassium efflux system, PhaF subunit  41.1 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2656  multiple resistance and pH regulation protein F  41.1 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.8 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.93 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0228  multiple resistance and pH regulation protein F  39.73 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  35.71 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.49 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  34.67 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.33 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3453  multiple resistance and pH regulation protein F  43.75 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592211  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3227  multiple resistance and pH regulation protein F  43.75 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142719  normal  0.055073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3719  multiple resistance and pH regulation protein F  35.62 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  34.18 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  33.82 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.15 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1587  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.49 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  29.11 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  34.62 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.65 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3809  multiple resistance and pH regulation protein F  34.25 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.332403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  42.67 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  26.92 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2488  multiple resistance and pH regulation protein F  31.71 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4320  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.94 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.38 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  36.99 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  34.67 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.77 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.735692  normal  0.139812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1445  multiple resistance and pH regulation protein F  30.67 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.93 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  36.9 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.21 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  28.75 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.65 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.88 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.38 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  34.94 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  40.98 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50690  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.48 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  29.11 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3621  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.67 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0308607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  30.95 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.88 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  45.59 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0152  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.91 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  30.49 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14790  Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)  40 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  32.86 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  48.53 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.08 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  27.5 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0493  multisubunit Na+/H+ antiporter, subunit F  32.81 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  30.49 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04213  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.94 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  30.49 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  26.83 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.06 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0899  multiple resistance and pH regulation protein F  32.93 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.857013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  37.93 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  27.71 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  29.49 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0701  multiple resistance and pH regulation protein F  30.14 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  26.58 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0753  multiple resistance and pH regulation protein F  31.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0206212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.36 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480103  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  26.92 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.567164  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.31 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0504  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.31 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1382  multiple resistance and pH regulation protein F  25.61 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2478  multiple resistance and pH regulation protein F  25.61 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.648417  normal  0.0636047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  34.62 
 
 		 88 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>