46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2932 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2932  multiple resistance and pH regulation protein F  100 
 
 		 86 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3227  multiple resistance and pH regulation protein F  69.23 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142719  normal  0.055073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3453  multiple resistance and pH regulation protein F  69.23 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592211  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1917  multiple resistance and pH regulation protein F  49.21 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.851543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11090  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  44 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1733  multiple resistance and pH regulation protein F  41.56 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.33 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  46.88 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  38.36 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.47 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26970  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  37.18 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  39.47 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  37.66 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  41.46 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.25 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  30.49 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.54 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  33.78 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  32.1 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  34.21 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  34.21 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0286  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.71 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.24 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  41.89 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  37.21 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2927  multiple resistance and pH regulation protein F  43.42 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  0.611551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0996  pH adaption potassium efflux system, PhaF subunit  37.66 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2656  multiple resistance and pH regulation protein F  37.66 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  28.75 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  30.67 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  35.94 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.62 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  32.91 
 
 		 107 aa  42  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.67 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0650  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.87 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0665  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.87 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000841525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.51 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  31.65 
 
 		 90 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.06 
 
 		 94 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0228  multiple resistance and pH regulation protein F  36.36 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2858  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.14 
 
 		 91 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  37.35 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0493  multisubunit Na+/H+ antiporter, subunit F  37.93 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  27.03 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  32 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3719  multiple resistance and pH regulation protein F  35.29 
 
 		 89 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>