52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1733 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1733  multiple resistance and pH regulation protein F  100 
 
 		 85 aa  154  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26970  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  45.88 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11090  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  45.12 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1917  multiple resistance and pH regulation protein F  45.71 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.851543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  37.97 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.8 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.59 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.33 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000561435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3227  multiple resistance and pH regulation protein F  42.65 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142719  normal  0.055073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3453  multiple resistance and pH regulation protein F  44.26 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592211  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  33.8 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  38.75 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  33.8 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0665  multiple resistance and pH regulation protein F  38.1 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2932  multiple resistance and pH regulation protein F  42.62 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.31 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  33.8 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.75 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.47 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.91 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  27.85 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  28.4 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2478  multiple resistance and pH regulation protein F  34.18 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.648417  normal  0.0636047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1382  multiple resistance and pH regulation protein F  34.18 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2927  multiple resistance and pH regulation protein F  40.85 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  0.611551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0152  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.91 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  27.5 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  34.72 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.52 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3809  multiple resistance and pH regulation protein F  30.56 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.332403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.12 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.85 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0187747  normal  0.214865 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3621  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0308607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  30.99 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1587  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.63 
 
 		 93 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3719  multiple resistance and pH regulation protein F  30.14 
 
 		 89 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  25.32 
 
 		 93 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  28.92 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.33 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  27.03 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  30 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.77 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.735692  normal  0.139812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  30 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  32.79 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  30.43 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.92 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  26.51 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28 
 
 		 94 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>