46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2514 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  48.74 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  40.87 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  40.71 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  37.9 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  33.6 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  42.53 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  38.6 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  37.72 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  35.35 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  35.11 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  36.73 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  33.02 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  26.96 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  29.37 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  29.37 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  29.37 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  35.64 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  34.38 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  29.92 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  25.2 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  30.95 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  34.88 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  29.81 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  30.93 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  37.93 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  37.93 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  25.41 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  32.56 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  27.48 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  30.61 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  39.71 
 
 		 137 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  30.25 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  30.25 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>