62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2873 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  246  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  98.39 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  93.55 
 
 		 124 aa  238  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  67.97 
 
 		 129 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  68.22 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  65.49 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  65.49 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  63.89 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  61.11 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  61.11 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  60.53 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  60.53 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  60.53 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  55.36 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  54.05 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  62.28 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  45.38 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  46.9 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  41.22 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  32.06 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  36.03 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  36.36 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  28.68 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  35.25 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  39.42 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  39 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  40.51 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  35.24 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  38.27 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  39 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  31.96 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  37.37 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  30.3 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  34.34 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  32 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  31.97 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  35.37 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  39.51 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  30.7 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  34.38 
 
 		 126 aa  47.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  34.88 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  33.94 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  33.75 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  31.53 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  35.51 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  35.78 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  26.32 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>