48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3238 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  48.28 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  38.58 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  42.98 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  42.15 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  42.15 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  44.23 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  44.57 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  38.02 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  44.74 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  43.9 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  40.71 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  40.29 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  35.09 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  38.68 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  39.83 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  35.51 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  41.67 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  36.64 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  36.64 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  35.11 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  35.11 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  35.11 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  35.11 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  35.42 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  32.52 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  31.97 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  31.97 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  30.08 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  34.92 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  37.4 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  34.69 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  30.28 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  35.85 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  34.86 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  35.59 
 
 		 128 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  31.71 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0883  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>