25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2121 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  258  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  39.5 
 
 
115 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  42.11 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  41.59 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  36.7 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  35.92 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  38.21 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  39.45 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  37.4 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  44.33 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  32.76 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  32.69 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  34.69 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  35.64 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  37.27 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  35.37 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  34.43 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  35.11 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  34.38 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  33.77 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  33.75 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  33.68 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  36.51 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  35.23 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  35.8 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>