51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3132 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  234  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  47.86 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  51.49 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  46.85 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  42.98 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  50.5 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  50.55 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  36.89 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  43.8 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  43.75 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  40.91 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  39.45 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  41.74 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  35.14 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  34.58 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  39.5 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  43.88 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  36.04 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  34.58 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  30.91 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  35.45 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  33.94 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  33.94 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  33.94 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  33.94 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  33.94 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  33.66 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  37.37 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  35.35 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  37.25 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  33.94 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  34.62 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  46.81 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  27.97 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  30.69 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  27.97 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  29.47 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  26.55 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>