61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2943 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  94.35 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  93.55 
 
 		 124 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  68.55 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  64.84 
 
 		 130 aa  159  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  62.96 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  63.39 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  63.39 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  61.11 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  61.11 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  58.26 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  58.26 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  58.26 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  54.62 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  53.78 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  55.36 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  52.25 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  60.87 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  47.06 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  50 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  30.28 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  40.46 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  37.39 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  31.78 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  39.82 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  35.9 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  40.51 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  35.24 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  34.48 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  35.37 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  30.3 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  35.35 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  29.29 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  36.59 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  29.66 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  29.66 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  35.58 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  39.53 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  32.32 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  31 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  39.51 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  29.06 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  31.15 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  31.01 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  35.85 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  33.33 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  35.51 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  28.42 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>