60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2838 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  100 
 
 
122 aa  244  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  48.74 
 
 
118 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  46.22 
 
 
124 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  47.06 
 
 
124 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  46.96 
 
 
122 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  45.38 
 
 
124 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  44.54 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  44.54 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  43.75 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  43.36 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  43.36 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  43.36 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  44.25 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  41.96 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  38.76 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  38.26 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  39.45 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  45.16 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  44.79 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  31.58 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  42.48 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  39.13 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  43.14 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  40.19 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  37.27 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  34.82 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  41.11 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  43.9 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  39.78 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  40.96 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  33.08 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  40.21 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  32.77 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  32.2 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  41.76 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  33.61 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  33.61 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  40.57 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  34.29 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  32.08 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  37.18 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  32.23 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  38.46 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  30.6 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  34.38 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  32.56 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>