67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1043 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1043  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 
82 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  84.15 
 
 
82 aa  139  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  67.9 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  68.06 
 
 
82 aa  98.2  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  56.1 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  33.77 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  32.47 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  32.47 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  45.07 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  29.87 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  38.67 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1362  hypothetical protein  35.44 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0925  hypothetical protein  41.33 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0996  hypothetical protein  29.87 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1637  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  34.18 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  35.21 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3138  protein of unknown function UPF0044  34.62 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  34.94 
 
 
106 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  35.8 
 
 
95 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  30.77 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2022  hypothetical protein  34.94 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.301242  normal  0.458518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  32.53 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1077  hypothetical protein  32.93 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  34.83 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1740  hypothetical protein  33.73 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.224936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  34.83 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  25.64 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  32.94 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00160  hypothetical protein  34.62 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  29.11 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  29.49 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  29.49 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  34.62 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  34.57 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  31.33 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  32.93 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1465  protein of unknown function UPF0044  32.93 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223382  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  33.73 
 
 
99 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  26.92 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  33.75 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  36.14 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0729  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.951229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1888  hypothetical protein  36.62 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3700  hypothetical protein  34.15 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  33.73 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2722  RNA-binding protein  31.25 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.94902  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2864  protein of unknown function UPF0044  32.93 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0666776  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  31.25 
 
 
98 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2615  hypothetical protein  36.47 
 
 
158 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  28.21 
 
 
101 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  33.73 
 
 
99 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>