162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1520 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  243  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  98.43 
 
 		 127 aa  239  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  87.1 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  95.28 
 
 		 127 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0996  hypothetical protein  61.34 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  37.21 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  29 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  34.88 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  29.21 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  33.72 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  33.72 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  33.72 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3738  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0371297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3604  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000221446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3983  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  35.21 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  30.59 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  29.87 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0180  protein of unknown function UPF0044  35.56 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  33.71 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  27.78 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  33.72 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0877  hypothetical protein  34.95 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932104  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2864  protein of unknown function UPF0044  35.58 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0666776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0700  protein of unknown function UPF0044  37.5 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  29.55 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  28.09 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  30.34 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  34.83 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  31.94 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  31.46 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  30.34 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  30.34 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  30.34 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  30.34 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  30.34 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  31.4 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1260  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1001  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.330419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0809  hypothetical protein  32.97 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  32.98 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  33.72 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  35.11 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  28.09 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  28.89 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2836  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231858  normal  0.0108243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  31.03 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  31.03 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  26.97 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  26.97 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3069  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00393169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2025  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1184  hypothetical protein  32.58 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233994 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1172  hypothetical protein  32.58 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  30.68 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  31.43 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2622  protein of unknown function UPF0044  28.89 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0942  hypothetical protein  26.97 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4437  hypothetical protein  32.58 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  36.36 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2358  protein of unknown function UPF0044  26.14 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.496102  hitchhiker  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  26.14 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2737  hypothetical protein  26.14 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1362  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0814  hypothetical protein  32.18 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  30.85 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1295  hypothetical protein  32.18 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1236  hypothetical protein  31.11 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000939316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3572  hypothetical protein  28.09 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  28.41 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03406  hypothetical protein  31.87 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  28.41 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>