49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0534 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 80 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  55.71 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1888  hypothetical protein  63.24 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  43.66 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  42.25 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  44.93 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  40.28 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  40.28 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  39.13 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  38.96 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  35.06 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0043  protein of unknown function UPF0044  38.36 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3138  protein of unknown function UPF0044  32.91 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0996  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1740  hypothetical protein  36.23 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.224936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  34.78 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2022  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.301242  normal  0.458518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  37.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  37.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  37.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  36.23 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0925  hypothetical protein  32.43 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1043  protein of unknown function UPF0044  45.07 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1362  hypothetical protein  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  34.78 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1978  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  36.84 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  36.23 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  36.23 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  39.13 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  36.23 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  28.99 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1236  hypothetical protein  33.75 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000939316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  31.88 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  30.43 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>