47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0043 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0043  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  36.51 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  34.92 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1974  protein of unknown function UPF0044  27.54 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  42.03 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  38.36 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0810  hypothetical protein  34.92 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  28.21 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  38.1 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  31.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  25.4 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  30 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  43.9  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  32.14 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  36.51 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  31.43 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5473  hypothetical protein  32.14 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62880  hypothetical protein  32.14 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  34.38 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0799  protein of unknown function UPF0044  25.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000186202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  28.57 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3138  protein of unknown function UPF0044  28.99 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0564  hypothetical protein  25.71 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00222762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  27.87 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3614  RNA-binding protein YhbY  30 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000635626  normal  0.233722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1850  hypothetical protein  26.87 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02996  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3372  RNA-binding protein YhbY  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.8642399999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  27.54 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4502  RNA-binding protein YhbY  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000031754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01665  RNA binding protein; ancient RNA-binding IF3-C fold  34.72 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00348819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3590  RNA-binding protein YhbY  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.48683e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3476  RNA-binding protein YhbY  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0520  RNA-binding protein YhbY  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000013717  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3665  RNA-binding protein YhbY  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03045  predicted RNA-binding protein  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000412792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0527  protein of unknown function UPF0044  28.57 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  36.51 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  33.85 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  33.85 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  33.85 
 
 		 97 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  35.38 
 
 		 96 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>