48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1974 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  66.67 
 
 		 80 aa  104  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  52.7 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1888  hypothetical protein  63.77 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  44 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  39.73 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  40 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  41.1 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  36 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  38.36 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2022  hypothetical protein  37.8 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.301242  normal  0.458518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1740  hypothetical protein  36.59 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.224936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  32.1 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  32.93 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0043  protein of unknown function UPF0044  42.03 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  33.77 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  32 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  38.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1362  hypothetical protein  42.03 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  38.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  38.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  38.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  38.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  38.36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  38.36 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  38.36 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  38.36 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  31.88 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  36.76 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  29.49 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3356  hypothetical protein  35.37 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  31.25 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  28.95 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  28.95 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  31.25 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  28.95 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  33.82 
 
 		 97 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  32.35 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42910  hypothetical protein  29.76 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.728949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  31.88 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0925  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  30.43 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3138  protein of unknown function UPF0044  31.94 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0230  RNA-binding protein  29.07 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0729  hypothetical protein  34.18 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.951229 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1523  protein of unknown function UPF0044  40.28 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>