23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0925 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0925  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  219  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  38.67 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  32.43 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  36.62 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  36.23 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0979  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  38.03 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  31.08 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  31.08 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3557  RNA-binding protein YhbY  36.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3594  RNA-binding protein YhbY  36.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0222253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3488  RNA-binding protein YhbY  36.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3487  RNA-binding protein YhbY  36.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3656  RNA-binding protein YhbY  36.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0001228  normal  0.404761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  31.25 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  31.08 
 
 		 105 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  35.29 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1123  protein of unknown function UPF0044  33.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000093514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3354  protein of unknown function UPF0044  50 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000296508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3473  protein of unknown function UPF0044  50 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000144439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  37.68 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  34.72 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>