36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1578 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1578  FHA domain containing protein  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290636  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0028  FHA domain containing protein  34.36 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.821389  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4708  FHA domain containing protein  44.83 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0820  FHA domain-containing protein  31.03 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  41.46 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  39.19 
 
 
268 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
302 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  42.31 
 
 
242 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  43.59 
 
 
241 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.8 
 
 
863 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  33.75 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  37.04 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
238 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4172  FHA domain containing protein  30.34 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13440  FHA domain-containing protein  29.63 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  32.99 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.44 
 
 
899 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.44 
 
 
903 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  43.14 
 
 
740 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  37.21 
 
 
456 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  29.41 
 
 
439 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
245 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  33.78 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  30.09 
 
 
354 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.73 
 
 
1004 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0069  FHA domain containing protein  35.54 
 
 
250 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  36.23 
 
 
236 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  36.25 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  33.33 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 
242 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2822  FHA domain-containing protein  47.73 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000875758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  39.73 
 
 
246 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4924  FHA domain-containing protein  35.29 
 
 
234 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  38.57 
 
 
189 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32990  predicted protein  35.38 
 
 
112 aa  40.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.35269  normal  0.113443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>