32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3400 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3400  exonuclease of the beta-lactamase fold class-like protein  100 
 
 		 791 aa  1597    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2890  beta-lactamase domain protein  43.9 
 
 		 551 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31669  normal  0.842026 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4186  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 		 545 aa  299  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  30.92 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4880  Beta-lactamase-like  30.41 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419128  hitchhiker  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3231  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 549 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2889  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 549 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 667 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1448  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 550 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 639 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 464 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0161  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 430 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.826932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0787  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 584 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  25.48 
 
 		 637 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3813  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 571 aa  48.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.16 
 
 		 636 aa  47.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.48 
 
 		 477 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 652 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 428 aa  47.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 630 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 641 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 642 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 		 830 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.02 
 
 		 644 aa  45.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  29.55 
 
 		 368 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 641 aa  44.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  36.84 
 
 		 555 aa  44.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  22.86 
 
 		 478 aa  44.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 640 aa  44.3  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 630 aa  44.3  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  26.19 
 
 		 636 aa  43.9  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>