More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1449 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1449  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  100 
 
 
254 aa  528  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3279  fumarate reductase iron-sulfur subunit  57.32 
 
 
245 aa  296  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00132  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.39 
 
 
252 aa  291  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0470  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.47 
 
 
244 aa  291  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002236  succinate dehydrogenase iron-sulfur protein  53.39 
 
 
252 aa  291  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2231  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.99 
 
 
252 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1724  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  55.04 
 
 
258 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0381  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3759  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.7 
 
 
245 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3937  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.87 
 
 
245 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11585  fumarate reductase iron-sulfur subunit frdB  54.55 
 
 
246 aa  278  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0631351  normal  0.974631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3814  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.61 
 
 
244 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3668  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.61 
 
 
244 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0418  fumarate reductase iron-sulfur subunit  51.02 
 
 
244 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0342  fumarate reductase iron-sulfur subunit  53.06 
 
 
244 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000194904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0715  fumarate reductase iron-sulfur subunit  50.61 
 
 
244 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04025  fumarate reductase (anaerobic), Fe-S subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5671  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.123167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03987  hypothetical protein  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4712  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4397  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4685  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4624  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3857  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4739  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4612  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.628867  normal  0.949615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4620  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4703  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4760  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.65 
 
 
244 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.596932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3837  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  52.24 
 
 
244 aa  275  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0353  fumarate reductase iron-sulfur subunit  49.79 
 
 
246 aa  268  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2789  fumarate reductase iron-sulfur subunit  52.32 
 
 
247 aa  268  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1278  fumarate reductase iron-sulfur subunit  48.63 
 
 
256 aa  268  8e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00864476  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0261  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  40 
 
 
249 aa  190  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0167  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  39.2 
 
 
264 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0670  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  40.69 
 
 
237 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.764736  normal  0.83201 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2128  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  41.56 
 
 
236 aa  175  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1355  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  39.57 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2359  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
237 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0211  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  39.83 
 
 
238 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0784  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  38.22 
 
 
232 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01874  succinate dehydrogenase catalytic subunit  38.43 
 
 
236 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000253868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0678  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.16 
 
 
232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000352148  normal  0.0375147 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0818  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.76 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0101  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  40.81 
 
 
236 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6465  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.62 
 
 
260 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0110  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  40.36 
 
 
236 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.767469  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0313  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.92 
 
 
248 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2078  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  34.71 
 
 
295 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1308  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.91 
 
 
265 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.170327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1426  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.52 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0151573  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2344  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.28 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0657231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1438  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.89 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.289291  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1836  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.65 
 
 
235 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0319754  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1798  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  37.12 
 
 
236 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0325296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1586  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.62 
 
 
256 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457155  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0964  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.9 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2509  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.28 
 
 
235 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0253294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0769  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.91 
 
 
256 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2629  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.28 
 
 
235 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1835  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.28 
 
 
235 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0785483  normal  0.205707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2516  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.28 
 
 
235 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0676  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.92 
 
 
319 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0212132  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0264  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  38.57 
 
 
236 aa  145  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05350  succinate dehydrogenase subunit B  33.19 
 
 
262 aa  144  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.100888  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1654  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.09 
 
 
235 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.224202  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4847  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.19 
 
 
256 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2184  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.52 
 
 
235 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0577  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.22 
 
 
240 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2253  succinate dehydrogenase catalytic subunit  39.13 
 
 
237 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1746  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0790  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0832878  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1832  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0687066  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0663  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2469  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0502  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2331  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1624  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2513  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  36.16 
 
 
235 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.60219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4645  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0902165  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2270  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.96 
 
 
235 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0879984  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5837  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21340  succinate dehydrogenase subunit B  31.44 
 
 
253 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13350  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  32.49 
 
 
263 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3830  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3591  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130742  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4430  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3937  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.16 
 
 
233 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0596  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.78 
 
 
240 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2815  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.22 
 
 
235 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2149  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.71 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0362  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein  35.9 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1323  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.32 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0573878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1709  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.65 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3314  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.71 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6095  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.32 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6506  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  36.32 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377091  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0845  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.06 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3178  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  35.15 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2844  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.78 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.501747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>