32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0790 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  73.49 
 
 		 509 aa  752    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 479 aa  999    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  46.95 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.01 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.35 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1767  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.59 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.180882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1273  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.34 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.07 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  45.66 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.19 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.17 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  39.07 
 
 		 1057 aa  325  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.48 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1741  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  40.04 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  39.83 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1508  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  39.22 
 
 		 482 aa  299  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  39.69 
 
 		 490 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  35.96 
 
 		 467 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  34.43 
 
 		 514 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40866  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.93 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0514596 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  33.12 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.14 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  24.53 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.89 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  25.13 
 
 		 626 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  25.13 
 
 		 626 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23639  precursor of phosphorylase udp-glucose diphosphorylase  25.41 
 
 		 712 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.15 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.15 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0088  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  27.56 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  20.81 
 
 		 395 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0003  hypothetical protein  20.93 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>