30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_52106 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  100 
 
 
626 aa  1285    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  100 
 
 
626 aa  1285    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  42.68 
 
 
600 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23639  precursor of phosphorylase udp-glucose diphosphorylase  43.44 
 
 
712 aa  470  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.59 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61206  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  22.51 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.561051 
 
 
-
 
NC_002620  TC0088  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  23.91 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  24.89 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.28 
 
 
407 aa  67  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.59 
 
 
472 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88889  predicted protein  23.1 
 
 
739 aa  64.7  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000760017  normal  0.165003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  23.55 
 
 
505 aa  64.3  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.33 
 
 
395 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.33 
 
 
395 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.88 
 
 
472 aa  60.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  24.46 
 
 
395 aa  57  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.13 
 
 
479 aa  54.7  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.05 
 
 
490 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  25 
 
 
465 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01520  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase, putative  22.95 
 
 
534 aa  50.4  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.38 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.9 
 
 
462 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.08 
 
 
490 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.83 
 
 
467 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1767  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.17 
 
 
460 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.180882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  22.98 
 
 
509 aa  48.5  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.84 
 
 
464 aa  47.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.03 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  23.93 
 
 
1057 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26644  predicted protein  22.71 
 
 
487 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.187464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>