36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  100 
 
 
465 aa  937    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  71.24 
 
 
459 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  67.32 
 
 
464 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  66.23 
 
 
461 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  62.3 
 
 
461 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  60.22 
 
 
461 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  60.27 
 
 
462 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1273  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  59.3 
 
 
460 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1767  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  55.97 
 
 
460 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.180882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  49.35 
 
 
509 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.95 
 
 
479 aa  418  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1741  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  50.46 
 
 
461 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  48.56 
 
 
1057 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.29 
 
 
490 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.26 
 
 
472 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.3 
 
 
467 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1508  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.77 
 
 
482 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  42.92 
 
 
490 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40866  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  37.38 
 
 
471 aa  236  6e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0514596 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  36.95 
 
 
514 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  37.1 
 
 
503 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.59 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.09 
 
 
472 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  25.82 
 
 
600 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.8 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  22.76 
 
 
626 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  22.76 
 
 
626 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0003  hypothetical protein  22.11 
 
 
488 aa  52.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1564  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase-like protein  31.25 
 
 
1125 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  24.5 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.2 
 
 
395 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.2 
 
 
395 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2597  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.08 
 
 
1119 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.826495  normal  0.093941 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61206  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.58 
 
 
486 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.561051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  21.46 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  22.89 
 
 
505 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>