24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0088 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0088  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  100 
 
 		 455 aa  940    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.17 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  34.86 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  31.11 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.86 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.86 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.86 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.78 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61206  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.23 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.561051 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26644  predicted protein  31.94 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.187464  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  32.53 
 
 		 505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01520  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase, putative  25.68 
 
 		 534 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  23.91 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  23.91 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  24.54 
 
 		 600 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.41 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88889  predicted protein  28.93 
 
 		 739 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000760017  normal  0.165003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.67 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.56 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.49 
 
 		 462 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.51 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.73 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23639  precursor of phosphorylase udp-glucose diphosphorylase  22.52 
 
 		 712 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910719  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0063  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  20.49 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>