31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1770 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  100 
 
 
395 aa  811    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  77.97 
 
 
395 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  77.97 
 
 
395 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26644  predicted protein  33.15 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.187464  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.14 
 
 
472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  32.22 
 
 
505 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01520  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase, putative  34.66 
 
 
534 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  29.43 
 
 
483 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61206  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.99 
 
 
486 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.561051 
 
 
-
 
NC_002620  TC0088  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  31.11 
 
 
455 aa  187  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.86 
 
 
489 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 
407 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  25.8 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  28.85 
 
 
514 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23639  precursor of phosphorylase udp-glucose diphosphorylase  27.66 
 
 
712 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.44 
 
 
461 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1741  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.53 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  24.46 
 
 
626 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  24.46 
 
 
626 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  27.03 
 
 
1057 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40866  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.7 
 
 
471 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0514596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.07 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  22.48 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.49 
 
 
459 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  24.88 
 
 
600 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.26 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  20.81 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  20 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  21.86 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.84 
 
 
467 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1508  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.38 
 
 
482 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>