29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54493 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  100 
 
 
600 aa  1240    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  42.77 
 
 
626 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  42.77 
 
 
626 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23639  precursor of phosphorylase udp-glucose diphosphorylase  41.58 
 
 
712 aa  415  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910719  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61206  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.05 
 
 
486 aa  91.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.561051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.05 
 
 
489 aa  89  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  28.75 
 
 
505 aa  87  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.7 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  26.32 
 
 
483 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002620  TC0088  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  24.54 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88889  predicted protein  25.42 
 
 
739 aa  70.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000760017  normal  0.165003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.16 
 
 
395 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.16 
 
 
395 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.53 
 
 
479 aa  62.4  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26644  predicted protein  23.64 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.187464  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.71 
 
 
465 aa  57.4  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.85 
 
 
407 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.46 
 
 
462 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.15 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01520  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase, putative  25.71 
 
 
534 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  22.56 
 
 
509 aa  51.2  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.05 
 
 
464 aa  51.2  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25 
 
 
461 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  24.88 
 
 
395 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1273  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.45 
 
 
460 aa  47.8  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  25.17 
 
 
503 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.54 
 
 
461 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.51 
 
 
467 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  25.99 
 
 
514 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>