36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2111 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
461 aa  900    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  66.23 
 
 
465 aa  586  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  69.06 
 
 
459 aa  578  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  66.16 
 
 
464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  62.61 
 
 
461 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  59.82 
 
 
462 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  59.38 
 
 
461 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1767  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  59.22 
 
 
460 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.180882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1273  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  58.64 
 
 
460 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  48.29 
 
 
509 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.19 
 
 
479 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1741  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  48.79 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  45.32 
 
 
1057 aa  396  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.62 
 
 
472 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1508  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.94 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  47.64 
 
 
490 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.14 
 
 
490 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.15 
 
 
467 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  35.09 
 
 
503 aa  259  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40866  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  37.16 
 
 
471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0514596 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  36.74 
 
 
514 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.22 
 
 
489 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  25.55 
 
 
483 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  20.74 
 
 
407 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.24 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0088  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  24.41 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  21.95 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  21.95 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  25 
 
 
600 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  27.27 
 
 
626 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  27.27 
 
 
626 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0003  hypothetical protein  23.2 
 
 
488 aa  49.3  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1564  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase-like protein  32.8 
 
 
1125 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  20.95 
 
 
395 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2597  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.13 
 
 
1119 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.826495  normal  0.093941 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  21.38 
 
 
505 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>