30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1273 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1273  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
460 aa  944    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  59.3 
 
 
465 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  57.83 
 
 
459 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  55.36 
 
 
464 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  58.64 
 
 
461 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  54.3 
 
 
461 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  55.1 
 
 
462 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  52.94 
 
 
461 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1767  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  52.72 
 
 
460 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.180882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  52.29 
 
 
509 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.34 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  45.94 
 
 
1057 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1741  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.54 
 
 
461 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1508  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.32 
 
 
482 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.76 
 
 
490 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.22 
 
 
472 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  42.7 
 
 
490 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.43 
 
 
467 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  37.08 
 
 
503 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  36.8 
 
 
514 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40866  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  36.04 
 
 
471 aa  237  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0514596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.39 
 
 
489 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.04 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.2 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54493  udp-n-acetylglucosamine diphosphorylase  26.45 
 
 
600 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1564  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase-like protein  23.53 
 
 
1125 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2597  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.14 
 
 
1119 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.826495  normal  0.093941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3747  2-alkenal reductase  22.11 
 
 
483 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  24.4 
 
 
626 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  24.4 
 
 
626 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>