35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1572 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1572  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
472 aa  983    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1315  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  52.42 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0358805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3172  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  49.68 
 
 
467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1508  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  47.98 
 
 
482 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0936  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.87 
 
 
490 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.470616 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1741  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.87 
 
 
461 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4019  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  46.93 
 
 
461 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.653575  normal  0.22665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17530  UDP-glucose pyrophosphorylase  47.5 
 
 
462 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0143593  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50444  UDP-Glucose- Pyrophosphorylase/Phosphoglucomutase  45.45 
 
 
1057 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00884767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19820  UDP-glucose pyrophosphorylase  44.26 
 
 
465 aa  360  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1794  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  44.07 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.36 
 
 
461 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1767  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.45 
 
 
460 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.180882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2111  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.75 
 
 
461 aa  349  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0840  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.86 
 
 
459 aa  340  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0363851  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0464  UDP-glucose pyrophosphorylase  40.72 
 
 
509 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1273  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.22 
 
 
460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0790  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  39.83 
 
 
479 aa  311  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.772556 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09148  UDP-glucose pyrophosphorylase (EC 2.7.7.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D1]  37.26 
 
 
514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.594117  normal  0.0631556 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40866  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  38.98 
 
 
471 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0514596 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03700  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative  36.59 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4027  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.25 
 
 
489 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52106  predicted protein  26.99 
 
 
626 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.222243 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51241  predicted protein  26.99 
 
 
626 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1564  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase-like protein  31.38 
 
 
1125 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2240  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.43 
 
 
395 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2202  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.43 
 
 
395 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00314503  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54703  udp-n-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.02 
 
 
472 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860159  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0003  hypothetical protein  23.64 
 
 
488 aa  50.1  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1770  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase family protein  22.26 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09094  Putative uncharacterized proteinUDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase ;(EC 2.7.7.23) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5I6D2]  24.22 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3128  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.37 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  25.68 
 
 
1101 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2597  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.75 
 
 
1119 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.826495  normal  0.093941 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61206  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.26 
 
 
486 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.561051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>