198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0186 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 806 aa  1676    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0622  putative acyltransferase  49.33 
 
 		 152 aa  162  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.265429  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  27.09 
 
 		 604 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  35.96 
 
 		 605 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  24.05 
 
 		 621 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  34.32 
 
 		 641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  24.1 
 
 		 602 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  25 
 
 		 673 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0620  putative acyltransferase  36.96 
 
 		 264 aa  126  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  27.82 
 
 		 632 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  32.89 
 
 		 621 aa  120  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  33.48 
 
 		 625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  29.52 
 
 		 604 aa  115  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  29.52 
 
 		 604 aa  115  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  25.45 
 
 		 607 aa  112  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  28.33 
 
 		 603 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  28.33 
 
 		 603 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  29.65 
 
 		 675 aa  104  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  30.25 
 
 		 646 aa  104  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  31.72 
 
 		 656 aa  104  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 690 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 710 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 642 aa  101  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 710 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  30.47 
 
 		 647 aa  100  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 695 aa  99.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  31.49 
 
 		 690 aa  99.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  29.31 
 
 		 584 aa  99  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0580  acyltransferase 3  24.13 
 
 		 602 aa  99  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  31 
 
 		 632 aa  98.6  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.22 
 
 		 671 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  30.54 
 
 		 645 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  29.39 
 
 		 642 aa  96.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  28.07 
 
 		 660 aa  95.5  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.12 
 
 		 662 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 684 aa  94.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  28.51 
 
 		 682 aa  94.7  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  28.17 
 
 		 681 aa  93.2  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  28.89 
 
 		 671 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  26.94 
 
 		 793 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.63 
 
 		 667 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  25.94 
 
 		 720 aa  92.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  32.2 
 
 		 640 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.17 
 
 		 634 aa  91.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  27.78 
 
 		 651 aa  91.3  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0621  putative acyltransferase  33.55 
 
 		 197 aa  90.5  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.550914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 977 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  29.49 
 
 		 625 aa  89.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 734 aa  89  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  24.67 
 
 		 688 aa  89.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 680 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  29.49 
 
 		 695 aa  89  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  29.49 
 
 		 628 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 681 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 681 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  28.86 
 
 		 710 aa  89  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  28.19 
 
 		 658 aa  88.2  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 675 aa  88.2  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  29 
 
 		 671 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  31.22 
 
 		 652 aa  88.2  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  27.27 
 
 		 654 aa  88.2  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.26 
 
 		 665 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  27.16 
 
 		 673 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 645 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  29.24 
 
 		 632 aa  87.4  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  25.83 
 
 		 711 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  24.48 
 
 		 690 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.58 
 
 		 658 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1253  acyltransferase 3  34.64 
 
 		 178 aa  85.9  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0633282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.69 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.16 
 
 		 622 aa  85.5  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.31 
 
 		 658 aa  85.1  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.51 
 
 		 660 aa  84.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.49 
 
 		 660 aa  84  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.69 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  29.48 
 
 		 759 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 647 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  26.42 
 
 		 716 aa  84  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  25.3 
 
 		 719 aa  84  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 629 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  25.36 
 
 		 716 aa  84  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  26.72 
 
 		 696 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.89 
 
 		 638 aa  84  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.11 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  29.29 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0716  putative acyltransferase  28.84 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.04 
 
 		 643 aa  82  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.72 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.32 
 
 		 656 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  28.33 
 
 		 583 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.44 
 
 		 695 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.12 
 
 		 656 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  26.61 
 
 		 679 aa  80.1  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  28.7 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 660 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  25.42 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.19 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>