28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1251 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  69.23 
 
 		 104 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  67.31 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  40.38 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  48.08 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  43.4 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  42.31 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  41.35 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  36.89 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  36.89 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  36.89 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  39.62 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  37.5 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  38.46 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  40.96 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5522  putative CcdB cytotoxin-like protein  36.11 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0819956  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  40.95 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  37.96 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3372  hypothetical protein  32.04 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  36.45 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  30.77 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  29.76 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3552  hypothetical protein  56.1 
 
 		 45 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773194  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  30.1 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  27.18 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  27.18 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  30.95 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>