27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2663 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  43.43 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  44.86 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  40.4 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  39.39 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  35.29 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  41 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  39.81 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5522  putative CcdB cytotoxin-like protein  32.04 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0819956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3552  hypothetical protein  64.86 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  32.61 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  32.61 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  32.61 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  32.35 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  30.19 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4237  hypothetical protein  35.35 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.205088  normal  0.553422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  37.08 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  38.2 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  37.08 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  25.25 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3372  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  25.49 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  24.51 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>