33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2488 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  210  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  84.62 
 
 		 104 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  69.23 
 
 		 104 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  41.35 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  42.31 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  42.31 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  42.31 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  44.23 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  41.35 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  42.31 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  40.57 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  39.62 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  35.85 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  38.1 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  36.54 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3372  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5522  putative CcdB cytotoxin-like protein  35.24 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0819956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  30.77 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  32.38 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  29.76 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  28.57 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  27.45 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  27.38 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  27.45 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  28.57 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  29.13 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  27.38 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  27.38 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  27.38 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0036  plasmid maintenance protein CcdB  28.57 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.78995 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3040  plasmid maintenance protein CcdB  26.19 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>