17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4253 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  51.52 
 
 		 99 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  40.4 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  40.96 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  37.35 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  39 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  34.34 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  31.37 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  33.33 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  33.33 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  33.33 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  31.37 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  33.33 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  31.03 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  32.18 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  31.03 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>