21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0216 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  42.68 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  46.34 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  48.78 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  40.24 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  39.29 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  41.46 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  35.37 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  35.37 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  35.37 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  40.74 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  32.93 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  39.51 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  37.35 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5522  putative CcdB cytotoxin-like protein  40.28 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0819956  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0037  plasmid maintenance protein CcdB  32.93 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  36.49 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0056  plasmid maintenance protein CcdB  31.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0050  plasmid maintenance protein CcdB  31.71 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  35.14 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0252  plasmid maintenance protein CcdB  31.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>